Birželio 9 dieną (1815 m.) Austrijos sostinėje Vienoje priimtas baigiamasis Vienos kongreso aktas, kuris nustatė naujas Europos valstybių sienas. Kongreso nutarimu panaikinta Varšuvos kunigaikštystė. Iš dalies buvusios Varšuvos kunigaikštystės žemių sudaryta Lenkijos kongreso karalystė, autonomijos teisėmis įjungta į Rusijos sudėtį. II Alytus prijungtas prie Rusijos.
Iki Vienos kongreso Alytus į I ir II buvo padalintas 1795 metais, kai Rusija, Prūsija ir Austrija įvykdė III Abiejų Tautų Respublikos padalijimą. Lietuvos teritorija buvo padalinta tarp Rusijos ir Prūsijos. Nemuno upe išvedus valstybinę sieną, dešiniakrantė Alytaus dalis atiteko Rusijos imperijai, kairiakrantė – Prūsijos karalystei.
I (Vilniaus) Alytus priklausė Vilniaus gubernijos Trakų apskričiai, II (Suvalkų) Alytus – Augustavo, nuo 1867 metų – Suvalkų gubernijos Kalvarijos apskričiai. I ir II Alytaus terminai pradėti naudoti tarpukario metais.